Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rps6ka3P18654 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka3P18654 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms