Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18530 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18530 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18530 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18530 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms