Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna3P16390 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna3P16390 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms