Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr1P16092 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr1P16092 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms