Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-D1P14427 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-D1P14427 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms