Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd5P13379 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd5P13379 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd5P13379 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd5P13379 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms