Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr4a1P12813 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms