Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApcsP12246 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApcsP12246 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms