Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FlgP11088 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FlgP11088 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FlgP11088 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FlgP11088 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FlgP11088 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FlgP11088 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FlgP11088 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FlgP11088 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms