Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Schip1P0DPB4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Schip1P0DPB4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms