Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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