Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Amd1P0DMN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms