Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb2P0C1T1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb2P0C1T1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms