Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TtrP07309 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtrP07309 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtrP07309 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtrP07309 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TtrP07309 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TtrP07309 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TtrP07309 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TtrP07309 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TtrP07309 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtrP07309 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtrP07309 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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