Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa7P02830 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa7P02830 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms