Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01806 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01806 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01806 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01806 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01806 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01806 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01806 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms