Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ccl20O89093 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ccl20O89093 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ccl20O89093 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ccl20O89093 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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