Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd160O88875 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd160O88875 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd160O88875 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms