Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sap30O88574 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sap30O88574 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sap30O88574 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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