Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms