Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AvilO88398 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AvilO88398 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AvilO88398 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AvilO88398 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AvilO88398 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AvilO88398 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AvilO88398 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AvilO88398 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AvilO88398 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms