Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms