Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SncaO55042 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncaO55042 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncaO55042 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncaO55042 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncaO55042 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms