Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl13O55038 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl13O55038 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl13O55038 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl13O55038 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl13O55038 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl13O55038 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cxcl13O55038 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cxcl13O55038 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cxcl13O55038 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cxcl13O55038 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cxcl13O55038 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl13O55038 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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