Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlkO54988 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlkO54988 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlkO54988 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlkO54988 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlkO54988 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlkO54988 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlkO54988 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SlkO54988 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms