Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema6bO54951 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema6bO54951 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema6bO54951 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms