Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TsksO54887 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TsksO54887 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TsksO54887 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TsksO54887 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TsksO54887 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TsksO54887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TsksO54887 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TsksO54887 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TsksO54887 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TsksO54887 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TsksO54887 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TsksO54887 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TsksO54887 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms