Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DffaO54786 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DffaO54786 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DffaO54786 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DffaO54786 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DffaO54786 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DffaO54786 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DffaO54786 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DffaO54786 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DffaO54786 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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