Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limk2O54785 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limk2O54785 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limk2O54785 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms