Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp15O54732 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp15O54732 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms