Protein–RNA interactions for Protein: O35719

Rad51b, DNA repair protein RAD51 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51bO35719 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51bO35719 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51bO35719 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51bO35719 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51bO35719 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51bO35719 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51bO35719 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms