Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnnO35691 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnnO35691 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnnO35691 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnnO35691 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PnnO35691 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnnO35691 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnnO35691 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnnO35691 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PnnO35691 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnnO35691 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms