Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag2O35638 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms