Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrt1O35449 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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