Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d1bO35324 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh2d1bO35324 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d1bO35324 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh2d1bO35324 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d1bO35324 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d1bO35324 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh2d1bO35324 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms