Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr1aO35134 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms