Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3cO35066 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3cO35066 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms