Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncoa3O09000 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncoa3O09000 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncoa3O09000 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms