Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MttpO08601 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MttpO08601 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MttpO08601 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MttpO08601 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms