Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec22bO08547 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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