Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc191J3QQ27 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc191J3QQ27 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc191J3QQ27 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc191J3QQ27 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc191J3QQ27 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms