Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms