Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5849J3QPE5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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