Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20918J3QN17 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms