Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc179J3QM76 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms