Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3727J3QM54 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3727J3QM54 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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