Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933406M09RikG3XA12 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms