Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn5F6UCX4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms