Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms