Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms